
Acrocera orbicula – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich i rodziny opękowatych.

Bujanka większa – gatunek muchówki z rodziny bujankowatych i podrodziny Bombyliinae. Szeroko rozprzestrzeniony w Nearktyce i Palearktyce, osiągający także północne skraje krainy orientalnej.

Chalarus spurius – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich i rodziny Pipunculidae.
Chyromya oppidana – gatunek muchówki z rodziny Chyromyidae.

Coproica ferruginata – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.

Copromyza equina – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Copromyzinae.

Copromyza stercoraria – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Copromyzinae.

Cuchna nawozowa – gatunek owada z rzędu muchówek.

Diastata vagans – gatunek muchówki z rodziny Diastatidae i podrodziny Diastatinae.

Doskwier pastwiskowy – gatunek muchówki z rodziny komarowatych. Niewielki, ciemno ubarwiony przedstawiciel rodziny. Występuje na wszystkich kontynentach z wyjątkiem Antarktydy i Ameryki Południowej, a także na licznych wyspach. Larwy rozwijają się w różnych zbiornikach słodkowodnych. Owady dorosłe migrują z miejsc rozrodu na znaczne odległości. Obie płcie żywią się nektarem, ale samice ponadto są agresywnymi hematofagami, ssącymi krew kręgowców, w tym ludzi. Gatunek jest wektorem wywołującej filariozę u psów Dirofilaria immitis, wywołującej tularemię Francisella tularensis oraz kilku arbowirusów.

Drosophila busckii – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.

Drosophila funebris – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.
Drosophila transversa – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.

Gnojka wytrwała – owad z rodziny bzygowatych. Długość 15-19 mm, barwy żółtawoszarej.

Gymnochiromyia flavella – gatunek muchówki z rodziny Chyromyidae.

Heleomyza serrata – gatunek muchówki z rodziny błotniszkowatych i podrodziny Heleomyzinae.

Hermetia illucens – szeroko rozprzestrzeniony gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych (Stratiomyidae), opisany naukowo w 1758 roku przez Karola Linneusza pod nazwą Musca illucens. Owad hodowany jest przez wiele firm na skalę przemysłową jako alternatywne źródło białka i tłuszczu do celów paszowych i jako surowiec dla przemysłu chemicznego, wykorzystywany także w procesie remediacji biomasy. Gatunek typowy rodzaju Hermetia.

Komar brzęczący, komar pospolity – występujący w krajach klimatu tropikalnego i subtropikalnego, także w klimacie umiarkowanym, gatunek owada z rodziny komarowatych (Culicidae), rzędu muchówek. Obok komara widliszka najbardziej rozpowszechniony komar na terenie Polski.

Komar egipski – gatunek komara z rzędu muchówek (Diptera).

Komar tygrysi – inwazyjny, szybko rozprzestrzeniający się gatunek owada z rodziny komarowatych (Culicidae), jeden z najbardziej rozpowszechnionych i najliczniej występujących komarów na całym obszarze Azji Południowo-Wschodniej, a jednocześnie najważniejszy z punktu widzenia mikrobiologii lekarskiej wektor, czyli gatunek roznoszący arbowirusy. Został zawleczony przez ludzi na inne kontynenty zagrażając ludziom takimi chorobami, jak chikungunya, denga, żółta febra, gorączka Zachodniego Nilu i japońskie zapalenie mózgu. W 1975 pojawił się na południu Europy i systematycznie przesuwa się na północ i zachód, zasiedlając kolejne kraje; w 2011 roku został stwierdzony w Bułgarii.

Komarnica błotniarka – gatunek owada z rzędu muchówek (Diptera). Szkodnik żyjący w wilgotnych glebach, podgryzający korzenie roślin. Szkody wyrządzają larwy, które w nocy żerują na naziemnych częściach młodych roślin.

Koziułka warzywna, komarnica warzywna, koziułkowiec – gatunek owada z rodziny koziułkowatych, często mylony z komarem widliszkiem. Uważany za szkodnika; występuje na glebach podmokłych i wilgotnych – wyrządza szkody wśród roślin przez podgryzanie korzeni i młodych roślin. Nieszkodliwy dla ludzi. Żyje od 4 do 6 dni.

Leptocera fontinalis – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.

Limosina silvatica – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.

Lotophila atra – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Copromyzinae.

Microchrysa polita – gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych i podrodziny Sarginae.

Mucha Billa Gatesa – mucha bzygowata, która występuje tylko w wysokogórskich wilgotnych lasach Kostaryki.

Mucha śrubowa - groźny pasożyt zwierząt i ludzi. Mucha śrubowa przypomina muchę domową jest jednak od niej trzy razy większa. Występuje na obszarze subtropikalnych krajów Ameryki Północnej i Południowej.

Nemopoda nitidula – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.

Neoleria inscripta – gatunek muchówki z rodziny błotniszkowatych i podrodziny Heleomyzinae.

Nieżłop nakwietny – gatunek muchówki z rodziny bzygowatych i rodzaju Pipiza.

Ploniarka zbożówka, mucha szwedzka – gatunek owada z rodziny niezmiarkowatych (Chloropidae). Żeruje na roślinach wiechlinowatych i może powodować różnej wielkości straty, w zależności od zaatakowanego gatunku rośliny oraz pokolenia. Ograniczeniu jej liczebności sprzyja między innymi prawidłowa agrotechnika.
Plujka pospolita, nazywana też muchą niebieską – gatunek muchówki z rodziny plujkowatych, nekrofag.

Pollenia angustigena – gatunek muchówki z rodziny plujkowatych i podrodziny Polleniinae.

Pollenia rudis – gatunek muchówki z rodziny plujkowatych i podrodziny Polleniinae.

Rachispoda limosa – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.
Rachispoda lutosa – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.

Saltella sphondylii – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.
Sargus bipunctatus – gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych i podrodziny Sarginae.

Sargus cuprarius – gatunek muchówki z rodziny lwinkowatych i podrodziny Sarginae.

Scaptomyza flava – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.

Scaptomyza pallida – gatunek muchówki z rodziny wywilżnowatych i podrodziny Drosophilinae.
Sepsis punctum – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.

Sernica pospolita – gatunek muchówki z rodziny sernicowate i podrodziny Piophilinae.

Setacera breviventris – gatunek muchówki z rodziny wodarkowatych i podrodziny Ephydrinae.

Sphaerocera curvipes – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Sphaerocerinae.

Strzyżak sarni, strzyżak jelenica – gatunek owada z rodziny narzępikowatych, rzędu muchówek. Pospolicie występuje na obszarach o klimacie umiarkowanym w Europie, północnych Chinach i na Syberii, został także zaintrodukowany do Ameryki Północnej.
Systoechus candidulus – gatunek muchówki z rodziny bujankowatych i podrodziny Bombyliinae.

Tephrochlamys rufiventris – gatunek muchówki z rodziny błotniszkowatych i podrodziny Heleomyzinae.

Themira annulipes – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.

Themira minor – gatunek muchówki z rodzinywońkowatych i podrodziny Sepsinae.
Themira putris – gatunek muchówki z rodziny wońkowatych i podrodziny Sepsinae.

Thoracochaeta zosterae – gatunek muchówki z rodziny Sphaeroceridae i podrodziny Limosininae.

Udnica cebulówka – gatunek muchówki z rodziny bzygowatych i podrodziny Eumerinae.

Wierzchołówka ognista – gatunek muchówki z rodziny łowikowatych i podrodziny Laphriinae. Zamieszkuje Europę, palearktyczną Azję i nearktyczną Amerykę Północną. Gatunek saproksyliczny. Larwy i owady dorosłe są drapieżne.

Wszolinka pszczela, wesz pszczela, pszczołówka – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich, grupy łękorysych i rodziny wszolinkowatych.

Wywilżna karłowata, drozofila karłówka, muszka owocowa, wywilżnia, wywilżanka, drozofila, octówka – niewielki owad z rzędu muchówek. Jest gatunkiem należącym do bezkręgowych organizmów modelowych. Został użyty przez Thomasa Morgana w badaniach nad chromosomową teorią dziedziczności. Owad ten jest też jednym z pierwszych zwierząt wykorzystywanych w bioastronautyce – od 1952 w lotach balonowych w górne warstwy atmosfery – i pierwszym zwierzęciem umieszczonym przez ludzi w przestrzeni kosmicznej.

Zgniłówka pokojowa, muszka jesienna – gatunek muchówki z rodziny zgniłówkowatych. Owad kosmopolityczny, pospolity, tworzący populacje synantropijne. Larwy rozwijają się w rozkładającej się materii organicznej, mogą wywoływać muszycę.
Zwiesek okienny, tanecznica okienna – gatunek muchówki z podrzędu krótkoczułkich i rodziny zwieskowatych.