
Archiwa w Toruniu – placówki naukowe, które gromadzą, przechowuje i udostępniają materiały archiwalne w Toruniu.
Archiwum Akt Dawnych Diecezji Toruńskiej im. ks. Alfonsa Mańkowskiego – instytucja, która gromadzi, przechowuje i udostępniania akta z terenu diecezji toruńskiej.

Archiwum Emigracji – samodzielna pracownia archiwalno-badawcza w Bibliotece Uniwersyteckiej Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu.

Archiwum Państwowe w Toruniu − jedno z najstarszych archiwów państwowych w Polsce.
Archiwum Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu – archiwum i jednocześnie jednostka ogólnouczelniana Uniwersytetu Mikołaja Kopernika o zadaniach naukowych, dydaktycznych i usługowych, gromadząca akta dotyczące historii i bieżącej działalności uczelni, akta studenckie i ogólne oraz spuścizny po wybitnych uczonych UMK. Jest najstarszym archiwum uczelnianym działającym na uniwersytecie powstałym po 1945 r.
Archiwum Wojskowe w Toruniu – archiwum wojskowe od 1957 roku z siedzibą w Toruniu.

Budynek Archiwum Państwowego w Toruniu – dawny budynek Miejskiej Komunalnej Kasy Oszczędności, obecnie siedziba Archiwum Państwowego w Toruniu.

Fundacja Generał Elżbiety Zawackiej w Toruniu - Archiwum i Muzeum Pomorskie AK oraz Wojskowej Służby Polek w Toruniu.