Według danych oficjalnych pochodzących z 2012 roku Mołdawia posiadała ponad 50 miast o ludności przekraczającej 5 tys. mieszkańców. Stolica kraju Kiszyniów jako jedyne miasto liczyło ponad pół miliona mieszkańców; 2 miasta z ludnością 100÷500 tys.; 1 miasto z ludnością 50÷100 tys., 7 miast z ludnością 25÷50 tys. oraz reszta miast poniżej 25 tys. mieszkańców.

Anenii Noi – miasto w południowo-wschodniej Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu o tej samej nazwie. W 2004 roku liczyło ok. 8 tys. mieszkańców.

Basarabeasca − miasto w południowo-wschodniej Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu Basarabeasca. W 2004 roku liczyło ok. 11 tys. mieszkańców.
Bielce – trzecie co do wielkości miasto Mołdawii, nazywane często „północną stolicą”. W 2004 roku liczyło ok. 123 tys. mieszkańców.

Biruința – miasto w północnej Mołdawii w rejonie Sîngerei; liczy 3,9 tys. mieszkańców.

Bryczany – miasto w północnej Mołdawii; stolica rejonu Briceni; liczy 9 tysięcy mieszkańców. Ośrodek przemysłu spożywczego.

Bucovăț – miasto w środkowej Mołdawii w rejonie Strășeni; liczy 1,8 tys. mieszkańców.

Căinari – miasto w południowo-wschodniej Mołdawii w rejonie Căușeni; liczy 4,8 tys. mieszkańców.

Călărași – miasto w środkowej Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu Călărași. W 2004 roku liczyło ok. 15 tys. mieszkańców.

Cantemir − miasto w Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu Cantemir. W 2004 roku liczyło ok. 4 tys. mieszkańców.

Căușeni – miasto w Mołdawii; 19 900 tysięcy mieszkańców (2012). Stolica rejonu Căușeni. W miejscowości znajduje się Cerkiew Zaśnięcia Matki Bożej.

Cimișlia − miasto w Mołdawii; stolica Rejonu Cimișlia, liczy 11 tysięcy mieszkańców (2006). Ośrodek przemysłu spożywczego.

Codru − miasto w Mołdawii, w rejonie Kiszyniów, liczy około 11,7 tys. mieszkańców. Ośrodek przemysłu chemicznego, spożywczego, maszynowego, włókienniczego. Położone 5 km od Kiszyniowa. Prawa miejskie posiada od 1977.

Cornești – miasto w zachodniej Mołdawii w rejonie Ungheni; liczy 3,3 tys. mieszkańców.

Costești – miasto w północno-zachodniej Mołdawii w rejonie Rîșcani; liczy 2,5 tys. mieszkańców.

Cricova – miasto w Mołdawii, położone 15 kilometrów na północ od Kiszyniowa, stolicy kraju. Cricova znana jest z winnych piwnic, które stały się atrakcją turystyczna tego małego miasteczka, liczącego obecnie 8,7 tysięcy mieszkańców.

Criuleni – miasto w Mołdawii, stolica rejonu Criuleni; 9,5 tys. mieszkańców (2012). Ośrodek przemysłu spożywczego.

Cupcini – miasto w północno-zachodniej Mołdawii w rejonie Edineţ. W latach 1958-1990 nazywało się Kalininsk. Według danych szacunkowych, w 2004 liczyło 9086 mieszkańców.

Dondușeni – miasto w Mołdawii; stolica rejonu Dondușeni; 8 tys. mieszkańców (2006). Ośrodek przemysłu spożywczego.
Drochia – miasto w Mołdawii; stolica rejonu Drochia. Ośrodek przemysłu spożywczego.

Dubosary – miasto w Mołdawii (Naddniestrze), nad Dniestrem, ośrodek administracyjny rejonu Dubosary. Liczba mieszkańców w 2014 roku wynosiła 25 060.

Durlești – miasto w Mołdawii, liczy około 19,8 tys. mieszkańców, w sąsiedztwie Kiszyniowa. Ośrodek przemysłu spożywczego.
Fălești – miasto w zachodniej Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu Fălești. W 2014 roku liczyło ok. 12,1 tys. mieszkańców.
Florești − miasto w Mołdawii; stolica rejonu Florești, liczy 16 tysięcy mieszkańców (2006). Ośrodek przemysłu spożywczego.

Frunză – miasto w północnej Mołdawii w rejonie Ocnița; liczy 1,4 tys. mieszkańców.

Ghindești – miasto w północno-wschodniej Mołdawii w rejonie Florești; liczy 2,1 tys. mieszkańców.

Glodeni – miasto w Mołdawii, stolica rejonu Glodeni, 10 146 mieszkańców (2006). Ośrodek przemysłu spożywczego.

Hîncești - miasto w centralnej Mołdawii, do 1990 Kotowsk; około 13 000 mieszkańców (2006). Miasto jest stolicą rejonu Hîncești, położone nad rzeką Cogîlnic 33 km na południowy wschód od stolicy kraju Kiszyniowa.

Ialoveni − miasto w Mołdawii, liczy 14 tysięcy mieszkańców (2006) oraz ma powierzchnię 31.65 km². Stolica rejonu Ialoveni. Miasto to jest oddalone od Kiszyniowa o 10 km. Ośrodek przemysłu spożywczego.

Iargara – miasto w południowo-zachodniej Mołdawii w rejonie Leova; liczy 4,8 tys. mieszkańców.

Jedyńce − miasto w północnej Mołdawii, 22 tysięcy mieszkańców (2006). Stolica rejonu Jedyńce.

Kiszyniów – stolica i największe miasto Mołdawii, zamieszkiwane przez 674,5 tys. mieszkańców.

Leova – miasto w południowej Mołdawii, położone 92 km na południowy zachód od stolicy Kiszyniowa na wschodnim brzegu rzeki granicznej z Rumunią - Prutu, stolica rejonu Leova. Liczba mieszkańców w 2012 roku wynosiła ok. 13 tys. Słynie z wyrobu dywanów.

Lipkany – miasto w Mołdawii liczące około 5 tysięcy mieszkańców. Położone w Besarabii, gdzie spotykają się granice Ukrainy, Mołdawii i Rumunii.
Mărculești – miasto w północno-wschodniej Mołdawii w rejonie Florești; liczy 2,1 tys. mieszkańców.
Nisporeni – miasto w Mołdawii; stolica rejonu Nisporeni; liczy 20 tysięcy mieszkańców (2006). Ośrodek przemysłu spożywczego. Po raz pierwszy wzmiankowane w 1618 r.

Ocnița – miasto w północnej Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu Ocnița. W 2014 roku liczyło ok. 7,3 tys. mieszkańców. Ośrodek przemysłowy.

Orgiejów – miasto we wschodniej Mołdawii, stolica rejonu Orhei; liczy 20 tys. mieszk. (2012), sobór z XVII wieku, pozostałości zamku. Od 1835 miasto.

Otaci − miasto w północnej Mołdawii, na prawym brzegu Dniestru; w rejonie Ocniţa. Liczy 8400 mieszkańców. Ośrodek przemysłowy. 15 km od miasta znajduje się klasztor Rudi. Siedziba klubu piłkarskiego Nistru Otaci.
Rezina – miasto w północnej części Mołdawii; stolica rejonu Rezina; liczy 8 tys. mieszkańców (2006). Położone na prawym brzegu Dniestru.

Rîșcani to stolica rejonu Rîșcani w Mołdawii. Liczy 12 232 mieszkańców (2004). Znacznie rozwinęło się w czasach komunistycznych.

Sîngera – miasto w środkowej Mołdawii w sektorze Botanica miasta Kiszyniowa. Według danych szacunkowych, w 2012 liczyło 8000 mieszkańców.

Sîngerei − miasto w Mołdawii; stolica rejonu Sîngerei; 13 tysięcy mieszkańców (2012). Ośrodek przemysłowy. W latach 1944-1991 nazywało się Lazowsk.

Șoldănești − miasto w Mołdawii; stolica rejonu Șoldănești; 8 tys. mieszkańców (2006). Ośrodek przemysłowy.

Soroki – miasto w północno-wschodniej części Mołdawii, przystań nad Dniestrem, 28 362 mieszkańców (2006); przemysł elektrotechniczny, spożywczy oraz odzieżowy. Stolica rejonu Soroca. Jedno z najstarszych miast Mołdawii. Miasto powszechnie uważane za stolicę mołdawskich Cyganów.

Ștefan Vodă – miasto w południowej Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu Ștefan Vodă. Ośrodek przemysłu spożywczego.
Straszany – miasto w Mołdawii; 16 tysięcy mieszkańców (2012), nad rzeką Byk. Stolica rejonu Străşeni.

Taraclia – miasto w Mołdawii; stolica rejonu Taraclia; 12 tysięcy mieszkańców (2006). Uniwersytet założony w 2004. Miasto zamieszkuje liczna mniejszość bułgarska.

Telenești – miasto w środkowej Mołdawii, siedziba administracyjna rejonu Telenești. W 2004 roku liczyło ok. 6,9 tys. mieszkańców.
Tvardița – miasto w południowo-wschodniej Mołdawii w rejonie Taraclia; liczy 5,8 tys. mieszkańców.

Ungheni – miasto w Republice Mołdawii; stolica rejonu Ungheni; nad Prutem; 35 tysięcy mieszkańców (2006). W mieście znajduje się przejście graniczne z Rumunią. Miastem partnerskim Ungheni jest Winston-Salem. Most nad Prutem jest jednocześnie kolejowym przejściem granicznym z Rumunią. Po drugiej stronie rzeki leży rumuńskie miasto o tej samej nazwie: Ungheni.

Vadul lui Vodă – miasto w Mołdawii, położone nad Dniestrem. W 2006 r. miasto to zamieszkiwało 4612 osób. W mieście rozwinęła się turystyka.

Vatra – miasto w środkowej Mołdawii, należące do gminy miejskiej Kiszyniów; liczy 3,5 tys. mieszkańców.