Bóg urojony – książka o religii i ateizmie, której autorem jest brytyjski naukowiec-biolog i ateista, Richard Dawkins. Argumentuje w niej, że nadprzyrodzony stwórca prawie na pewno nie istnieje, a wiarę w niego można uznać za urojenie, czyli uporczywe obstawanie przy błędnym poglądzie nawet wobec zaprzeczających mu silnych dowodów. Zgadza się ze stwierdzeniem Roberta Pirsiga z książki Zen i sztuka oporządzania motocykla – „jeżeli jedna osoba cierpi na urojenie, nazywamy to szaleństwem. Jeżeli wiele osób cierpi na urojenie, nazywamy to religią”.

Coś mocniejszego – zbiór opowiadań autorstwa Rafała Ziemkiewicza, który ukazał się w 2006 roku nakładem wydawnictwa Fabryka Słów. Wstęp do antologii napisał Maciej Parowski. Książka jest częścią serii wydawniczej Bestsellery Polskiej Fantastyki.

Deus caritas est – pierwsza encyklika napisana przez papieża Benedykta XVI. Poświęcona jest miłości, w jej wymiarze seksualnym, społecznym i nadprzyrodzonym. Papież podkreśla w niej, że miłość Boga i miłość bliźniego są nierozłączne i stanowią jedno przykazanie. Została ogłoszona i opublikowana 25 stycznia 2006 roku w ośmiu językach. W 42 paragrafach papież pisze na temat wątku miłości, porusza temat charytatywnej działalności Kościoła i relacji między wiarą i polityką.

Gottland – zbiór reportaży Mariusza Szczygła poświęconych Czechom wydany w 2006 w Wołowcu przez Wydawnictwo Czarne; wybór czytelników Nagrody „Nike” 2007, nagrodzony Nagrodą im. Beaty Pawlak 2007 oraz Europejską Nagrodą Książkową 2009.

Letter to a Christian Nation – książka napisana przez Sama Harrisa w odpowiedzi na reakcje wywołane jego pierwszą książką Koniec wiary. Napisana jest w formie listu otwartego skierowanego do chrześcijanina. Zamierzeniem autora jest obalenie intelektualnych i moralnych ambicji chrześcijaństwa w najczęściej spotykanych formach. Książka została wydana we wrześniu 2006, a w październiku była na siódmym miejscu listy bestsellerów New York Timesa.
Odczarowanie. Religia jako zjawisko naturalne – książka amerykańskiego filozofa Daniela Dennetta, w której przedstawia projekt naukowej analizy zjawiska religii, w celu przewidzenia jej przyszłości. Rozważa argumenty za i przeciwko takiej analizie. Pisze, że zaklęciem, które ma nadzieje złamać, nie jest religia sama w sobie, ale przekonanie, że religia jest poza granicami naukowych dociekań.

Rio Anaconda: gringo i ostatni szaman plemienia Carapana – książka przygodowa i podróżnicza Wojciecha Cejrowskiego, opowiadająca o wyprawach autora do ostatnich dzikich plemion Amazonii. Książka zawiera również fotografie z wypraw w różne rejony świata. Wydana przez wydawnictwo Bernardinum oraz Poznaj Świat w 2006 roku. W pierwszym miesiącu sprzedaży sprzedano ponad 15 000 egzemplarzy. Dotychczas sprzedano ponad 250 000 książek.